Die Zentrale Endoskopieabteilung (Leitung: Prof. Dr. med. Konturek) wird interdisziplinär zwischen den Kollegen der Medizinischen Klinik (CA Prof. Dr. med. Konturek) und der Klinik für Allgemein- und Viszeralchirurgie (CA Dr. med. Helfritzsch) betrieben.

Es werden jährlich etwa 5.000 Untersuchungen aus allen Bereichen der Gastroenterologie durchgeführt:

• diagnostische und interventionelle Sonografie (z.B. Punktionen und Drainagen) sowie Duplex-Sonografie (Gefäßdarstellung) des Abdomens
• bei bestimmten Fragestellungen  (unklare Leberherde) auch Kontrastmittel-Sonografie mit ggf. Punktion zur Histologiegewinnung (feingewebliche Untersuchung)
• Endo-Sonografie des oberen (Speiseröhre, Magen, Zwölffingerdarm) und unteren (Enddarm) Gastrointestinaltraktes zur Krebsfrühdiagnostik und Therapieplanung
• Diagnostische und therapeutische Endoskopien der Speiseröhre, des Magens und des Zwölffingerdarmes (Ösophago-Gastro-Duodenoskopie) sowie des Dick- und Enddarmes (Koloskopie, Sigmoideoskopie, Rektoskopie) mit Entnahme von Gewebeproben, Blutstillung, Polypabtragung, Fremdkörperentfernung oder lokaler Tumorbehandlung (Dickdarmspiegelung mit Einsatz von Kohlendioxid)
• Fäkale Bakterientherapie (Stuhltransplantation)
• Sklerosierungstherapie und Gummibandligaturen von Speiseröhren- und Magenvarizen (Krampfadern)
• Endoskopische Behandlung von Verengungen im oberen und unteren Magen-Darm-Trakt durch Aufdehnen (Bougieren), Einsetzen von Röhrenprothesen (Stents) oder selbstexpandierenden röhrenartigen Metallgittern (Wallstents)
• Untersuchung des Dünndarmes (Doppelballonenteroskopie) einschließlich Probeentnahmen und Blutstillung
• Kapselendoskopie
• Endoskopische Untersuchung des Gallen- und Bauchspeicheldrüsenganges unter Röntgensicht (ERCP), ggf. mit Schlitzung der Mündung (Papillotomie), Entfernung von im Gang liegenden Steinen oder Einlegen von Drainagen (Stents)
• Perkutane Verfahren der Gallengangdiagnostik (PTC) und Therapie einschließlich Stentimplantation und Anlage perkutaner Gallengangdrainagen (PTCD) in Zusammenarbeit mit den Radiologen (auch sogenannte Rendezvous-Verfahren)
• Anlage perkutaner Ernährungssonden in den Magen (PEG) und Dünndarm (PEJ)
•  Moderne Funktionsdiagnostik der Speiseröhre (Manometrie, pH-Metrie) bei Schluckstörungen, unklaren Brustbeschwerden oder Sodbrennen, welches nicht auf Medikamente anspricht

Zusätzlich werden Spiegelungen des Kehlkopfes, der Luftröhre und der Bronchien (Bronchoskopie) durchgeführt, insbesondere zur Diagnostik von Lungentumoren.

Regelmäßig erfolgen interdisziplinäre Besprechungen zwischen den Kollegen der Medizinischen und Viszeralchirurgischen Klinik zur Befundbesprechung, um für den Patienten den individuell besten Behandlunsplan zu erstellen.

Für Notfälle (insbesondere Blutungen aus dem Magen-Darm-Bereich, Entfernung von Fremdkörpern) wird ein 24h-Bereitschaftsdienst vorgehalten- auch an Sonn- und Feiertagen.